随着新技术允许科学家们深入研究基因组和外显子组,一类新的称为环状 RNA(circular RNA, circRNA)的 RNA 可能发挥着一种有趣的作用。
在一项新的研究中,来自美国密歇根大学的研究人员对多种癌症中的 circRNA 进行了编目,并进行了初步研究,表明这些稳定的结构可能作为血液或尿液中的癌症生物标志物。相关研究结果发表在 2019 年 2 月 7 日的 Cell 期刊上,论文标题为「The Landscape of Circular RNA in Cancer」。
这项新的研究确定了癌症中的 circRNA 目录,从而为未来的研究构建了一个数据库。论文共同通讯作者、密歇根大学转化病理学中心主任 Arul M. Chinnaiyan 博士说,「我对 circRNA 作为非侵入性生物标志物的潜力感到非常兴奋。鉴于它们的稳定性,我们可能能够在癌症患者的血液或尿液中检测到它们。这可能对癌症的诊断或预后有用。」
作为 MiONCOSEQ 项目的一部分,这些研究人员从 800 多个肿瘤样本中发现了 circRNA。他们证实为 MiONCOSEQ 项目开发的捕获 RNA 测序在检测 circRNA 方面比现有方法更为强大。
Chinnaiyan 说,「这种捕获方法可能是有限的,这是因为它基于我们用来捕获 RNA 的探针。但是,全外显子组捕获方法使得它具有重大的意义。我们通过这种方式捕获大量的 RNA。这就是为何我们能够鉴定出如此多的之前并不知道的 circRNA。」
这种技术仅需少量总 RNA 就能够鉴定出 circRNA。这意味着它们可能在 RNA 被稀释的地方被检测到,比如血液或尿液。
此外 ,这些研究人员还鉴定出几种在前列腺癌组织中发现的 circRNA。通过评估来自前列腺癌细胞的 circRNA,他们发现它们比线性 RNA 更稳定。它们也可在尿液样品中检测到。
Chinnaiyan 说,「我们能够证实这些 circRNA 存在于尿液中并且来自前列腺癌的 circRNA 可被检测到。我们未来的研究将探究这些 circRNA 作为尿液或血液中的癌症生物标志物。]
circRNA 是一种非编码 RNA,它们形成闭合的环状结构而不是线性结构。新的 RNA 测序方法曝光了这些 circRNA,但是人们对它们起作用的原因或方式知之甚少。不过它们的稳定结构使得它们成为癌症生物标志物的理想候选对象。
这些研究人员将他们的研究结果转变为一个名为 MiOncoCirc 的数据库,这个数据库对肿瘤样本中报道的 circRNA 进行编目。这种资源可供科学家们使用,有助于开发新的癌症生物标志物。